3.12.1939 (illalla) päämaja siirrettiin Mikkeliin. Jo ennen päämajan siirtymistä rakennettiin Mikkeliin sen toimintaa varten tarpeelliset toiminnot. Mikkelin yläkansakoululle asennettiin puhelin- ja lennätinkeskus lokakuun 1939 puolivälissä. Päämajan eri osastojen sijoittamista Mikkeliin ja sen lähiympäristöön selvitettiin lokakuun 1939 lopulla.
Ylipäällikkö Mannerheim asettui lähimpien upseeriensa kanssa yläkansakoululle koko Keskuskansakoulun ollessa päämajan käytössä. Päämajan monenlaiset osastot eivät kuitenkaan mahtuneet Keskuskansakoululle, vaan eri osastoja ja toimistoja oli sijoitettava eri puolille Mikkeliä ja sen ympäristöä, esimerkiksi Mikkelin maalaiskunnassa sijaitsevaan Otavaan sijoitettiin propagandaosasto, koulutusosasto, sotahistoriantoimisto ja topografikunta. Ylipäällikön ja muiden upseerien käyttöön majoitustiloiksi otettiin samoin kuin kansalaissodan aikana käyttöön hotelli Seurahuone.
Yksittäisiä tapahtumia päämajassa tänä aikana:
10.12.1939 Pääministeri Ryti kävi tutustumassa päämajassa puolustusvoimien toimintaan.
15.12.1939 Päämajan tiedotus nro.1: http://digi.narc.fi/digi/view.ka?kuid=1559185 (Tolvajärven taistelu päättynyt voittoisasti)
19.12.1939 Sodan johdon ja päämajan toimenpiteitä: http://digi.narc.fi/digi/view.ka?kuid=1559211 (Suomussalmen ratkaisutaisteluiden valmistelut alkavat)
26.12.1939 Pääministeri Ryti kävi toistamiseen päämajassa tutustumassa tilanteeseen.
